Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms