Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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