Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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