Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms