Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms