Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SFTPCP11686 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SFTPCP11686 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SFTPCP11686 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SFTPCP11686 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SFTPCP11686 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SFTPCP11686 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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