Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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