Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms