Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms