Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYCP2Q9BX26 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms