Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms