Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.6 ms