Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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