Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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