Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms