Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms