Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms