Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HOXD12P35452 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HOXD12P35452 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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