Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRHP20396 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms