Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCP1P17987 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCP1P17987 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCP1P17987 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCP1P17987 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCP1P17987 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCP1P17987 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCP1P17987 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCP1P17987 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCP1P17987 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms