Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GSTA4-202ENST00000370960 859 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP2-1-201ENST00000391419 776 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPA1P44-201ENST00000503999 879 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z73429.1-201ENST00000610170 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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KRTAP9-4Q9BYQ2 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAP2-203ENST00000465994 1404 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR3A2-206ENST00000642052 1748 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 BMS1P4-201ENST00000441263 1332 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC13-AS1-201ENST00000418161 2049 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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