Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms