Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms