Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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