Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms