Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms