Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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