Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms