Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms