Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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