Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms