Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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