Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms