Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms