Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms