Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAN1Q9Y2M0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms