Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms