Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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