Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms