Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGF29Q96ES7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGF29Q96ES7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGF29Q96ES7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGF29Q96ES7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGF29Q96ES7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGF29Q96ES7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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