Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms