Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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GABRA6Q16445 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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GABRA6Q16445 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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GABRA6Q16445 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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GABRA6Q16445 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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GABRA6Q16445 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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GABRA6Q16445 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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