Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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