Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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SHPRHQ149N8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SHPRHQ149N8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SHPRHQ149N8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SHPRHQ149N8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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