Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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FHL3Q13643 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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