Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms