Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms