Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNK4Q9NYG8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms