Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms