Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms